«Специя» основана в 1906 году швейцарцем Германом Урни.
До Второй мировой войны клуб мало чем отличался – несколько региональных побед, постоянные повышения и понижения в классе. В военное время «Специя» была на грани исчезновения – президента клуба, Периоли, арестовали и отправили в концентрационный лагерь.
Было опасно продолжать играть под прежним названием, поэтому другой руководитель, Семориле, обратился к командиру пожарной части Специи и попросил его представлять клуб. Новую команду назвали «Спортивная команда 42-й пожарной части», а состав оставили прежним. Именно этот состав в 1944 году принес первое и единственное чемпионство. Однако из-за военного положения и измененного формата турнира руководство лиги до 2002 года не признавало этот результат.
В 2008 году «Специя» стала банкротом и опустилась в Серию Д. Найдя финансирование, клуб начал подъем по турнирной лестнице. В 2020 году «Специя» провела свой первый матч в Серии А – впервые за всю историю команды.
С 2019 года «Специю» тренирует Винченцо Итальяно.